Domande taggate «sequence-analysis»

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Inquadratura della distribuzione binomiale negativa per il sequenziamento del DNA
La distribuzione binomiale negativa è diventata un modello popolare per i dati di conteggio (in particolare il numero previsto di letture di sequenziamento all'interno di una determinata regione del genoma da un determinato esperimento) in bioinformatica. Le spiegazioni variano: Alcuni lo spiegano come qualcosa che funziona come la distribuzione di …
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Perché Anova () e drop1 () hanno fornito risposte diverse per i GLMM?
Ho un GLMM del modulo: lmer(present? ~ factor1 + factor2 + continuous + factor1*continuous + (1 | factor3), family=binomial) Quando uso drop1(model, test="Chi"), ottengo risultati diversi rispetto a quelli che utilizzo Anova(model, type="III")dal pacchetto auto o summary(model). Questi ultimi due danno le stesse risposte. Usando un mucchio di dati fabbricati, …
10 r  anova  glmm  r  mixed-model  bootstrap  sample-size  cross-validation  roc  auc  sampling  stratification  random-allocation  logistic  stata  interpretation  proportion  r  regression  multiple-regression  linear-model  lm  r  cross-validation  cart  rpart  logistic  generalized-linear-model  econometrics  experiment-design  causality  instrumental-variables  random-allocation  predictive-models  data-mining  estimation  contingency-tables  epidemiology  standard-deviation  mean  ancova  psychology  statistical-significance  cross-validation  synthetic-data  poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis  distributions  binomial  classification  k-means  distance  unsupervised-learning  euclidean  correlation  chi-squared  spearman-rho  forecasting  excel  exponential-smoothing  binomial  sample-size  r  change-point  wilcoxon-signed-rank  ranks  clustering  matlab  covariance  covariance-matrix  normal-distribution  simulation  random-generation  bivariate  standardization  confounding  z-statistic  forecasting  arima  minitab  poisson-distribution  negative-binomial  poisson-regression  overdispersion  probability  self-study  markov-process  estimation  maximum-likelihood  classification  pca  group-differences  chi-squared  survival  missing-data  contingency-tables  anova  proportion 
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Come dimostrare la cooperazione dalle sequenze comportamentali
Situazione: due uccelli (maschio e femmina) proteggono le loro uova nel nido contro un intruso. Ogni uccello può usare un attacco o una minaccia per proteggersi ed essere presente o assente. Esiste uno schema che emerge dai dati secondo cui il comportamento può essere complementare: gli attacchi maschili mentre le …
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