Usa questo tag per qualsiasi domanda * sull'argomento * che (a) coinvolga `R` come parte critica della domanda o risposta prevista, e (b) non è * solo * su come usare` R`.
Sto adattando un modello lineare in R usando glmnet. Il modello originale (non regolarizzato) è stato montato usando lme non aveva un termine costante (cioè era nella forma lm(y~0+x1+x2,data)). glmnetprende una matrice di predittori e un vettore di risposte. Ho letto la glmnetdocumentazione e non trovo alcuna menzione del termine …
Chiuso. Questa domanda è fuori tema . Al momento non accetta risposte. Vuoi migliorare questa domanda? Aggiorna la domanda in modo che sia in argomento per Cross Validated. Chiuso 2 anni fa . Vorrei imparare a usare Rcpp . Ho esaminato i documenti sul sito Web CRAN del pacchetto, ma …
Se si sta testando l'ipotesi di omoscedasticità, sono disponibili test parametrici (Bartlett Test of Homogeneity of Variances, bartlett.test) e non parametrici (Figner-Killeen Test of Homogeneity of Variances, fligner.test). Come dire quale tipo usare? Ciò dovrebbe dipendere, ad esempio, dalla normalità dei dati?
Sto esaminando alcuni dati di copertura genomica che è fondamentalmente un lungo elenco (alcuni milioni di valori) di numeri interi, ognuno dei quali dice quanto bene (o "in profondità") sia coperta questa posizione nel genoma. Vorrei cercare "valli" in questi dati, cioè regioni che sono significativamente "più basse" del loro …
Devo analizzare con R i dati di un sondaggio medico (con oltre 100 colonne codificate) che arriva in un CSV. Userò sonaglio per un po 'l'analisi iniziale, ma dietro le quinte è ancora R. Se leggo il file.csv () , le colonne con codici numerici vengono trattate come dati numerici. …
Di recente ho iniziato a conoscere i modelli misti lineari generalizzati e stavo usando R per esplorare quale differenza fa per trattare l'appartenenza al gruppo come effetto fisso o casuale. In particolare, sto guardando il set di dati di esempio discusso qui: http://www.ats.ucla.edu/stat/mult_pkg/glmm.htm http://www.ats.ucla.edu/stat/r/dae/melogit.htm Come indicato in questo tutorial, l'effetto …
Ho un set di dati con colonne a b c(3 attributi). aè numerico e continuo mentre be csono categorici ciascuno con due livelli. Sto usando il metodo vicini K-Nearest per classificare ae bsu c. Quindi, per poter misurare le distanze trasformo il mio set di dati rimuovendo, baggiungendo b.level1e b.level2. …
Questa è più una domanda concettuale, ma mentre uso Rfarò riferimento ai pacchetti in R. Se l'obiettivo è quello di adattare un modello lineare ai fini della previsione, e quindi fare previsioni in cui gli effetti casuali potrebbero non essere disponibili, ci sono dei vantaggi nell'utilizzare un modello a effetti …
"Residui studentizzati" e "Residui standardizzati" sono gli stessi nei modelli di regressione? Ho costruito un modello di regressione lineare in R e volevo tracciare il grafico dei valori adattati dei residui Studentized v / s, ma non ho trovato un modo automatizzato per farlo in R. Supponiamo che io abbia …
Situazione: due uccelli (maschio e femmina) proteggono le loro uova nel nido contro un intruso. Ogni uccello può usare un attacco o una minaccia per proteggersi ed essere presente o assente. Esiste uno schema che emerge dai dati secondo cui il comportamento può essere complementare: gli attacchi maschili mentre le …
Carica il pacchetto necessario. library(ggplot2) library(MASS) Genera 10.000 numeri adattati alla distribuzione gamma. x <- round(rgamma(100000,shape = 2,rate = 0.2),1) x <- x[which(x>0)] Disegna la funzione di densità di probabilità, supponendo che non sappiamo a quale distribuzione x si adatta. t1 <- as.data.frame(table(x)) names(t1) <- c("x","y") t1 <- transform(t1,x=as.numeric(as.character(x))) t1$y …
Contesto Sto cercando di capire come R's coxph () accetta e gestisce le voci ripetute per soggetti (o paziente / cliente, se preferisci). Alcuni lo chiamano formato lungo, altri lo chiamano "misure ripetute". Vedere ad esempio il set di dati che include la colonna ID nella sezione Risposte all'indirizzo: I …
Secondo la documentazione della removeSparseTermsfunzione dal tmpacchetto, questo è ciò che comporta la scarsità: A term-document matrix where those terms from x are removed which have at least a sparse percentage of empty (i.e., terms occurring 0 times in a document) elements. I.e., the resulting matrix contains only terms with …
La funzione R cv.glm (libreria: avvio) calcola l'errore di stima della convalida incrociata K stimato per i modelli lineari generalizzati e restituisce delta. Ha senso usare questa funzione per una regressione del lazo (libreria: glmnet) e, in tal caso, come può essere eseguita? La libreria glmnet usa una validazione incrociata …
Sto analizzando i dati di tracciamento oculare da un esperimento progettato. Una versione semplificata dei miei dati è simile a questa (Puoi ottenere i dati dput () qui ), head(lookDATA) participant fixationImage fixationCount 1 9 Automobile 81 2 9 Bird 63 3 9 Chair 82 4 9 Dog 64 5 …
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