Domande taggate «microarray»


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Come funziona la normalizzazione quantile?
Negli studi sull'espressione genica usando microarrays, i dati di intensità devono essere normalizzati in modo che le intensità possano essere confrontate tra individui, tra geni. Concettualmente e algoritmicamente, come funziona la "normalizzazione quantile" e come spiegheresti questo a un non statistico?

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Calcolo della probabilità di sovrapposizione dell'elenco genico tra un set di dati RNA seq e un chip ChIP
Spero che qualcuno su questi forum possa aiutarmi con questo problema di base negli studi sull'espressione genica. Ho fatto il sequenziamento profondo di un tessuto sperimentale e di controllo. Ho quindi ottenuto valori di arricchimento di piega dei geni nel controllo sperimentale del campione. Il genoma di riferimento ha ~ …

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Differenze tra PROC Mixed e lme / lmer in R - gradi di libertà
Nota: questa domanda è una risposta, poiché la mia domanda precedente doveva essere cancellata per motivi legali. Confrontando PROC MIXED da SAS con la funzione lmedel nlmepacchetto in R, mi sono imbattuto in alcune differenze piuttosto confuse. Più specificamente, i gradi di libertà nei diversi test differiscono tra PROC MIXEDe …
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