Statistiche e Big Data mixed-model

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Ho usato il MCMCglmmpacchetto di recente. Sono confuso da ciò che viene indicato nella documentazione come struttura a R e struttura a G. Questi sembrano riguardare gli effetti casuali - in particolare specificando i parametri per la distribuzione precedente su di essi, ma la discussione nella documentazione sembra presumere che …

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Come analizzare i dati di conteggio longitudinale: tenere conto dell'autocorrelazione temporale in GLMM?

Buongiorno guru statistici e maghi di programmazione R, Sono interessato a modellare catture di animali in funzione delle condizioni ambientali e del giorno dell'anno. Come parte di un altro studio, ho conteggi di catture in circa 160 giorni in tre anni. In ognuno di questi giorni ho temperatura, precipitazioni, velocità …

16 r mixed-model autocorrelation bugs panel-data

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Perché è necessario utilizzare REML (anziché ML) per scegliere tra i modelli var-covar nidificati?

Varie descrizioni sulla selezione del modello sugli effetti casuali dei Modelli misti lineari indicano l'uso del REML. Conosco la differenza tra REML e ML ad un certo livello, ma non capisco perché REML debba essere usato perché ML è di parte. Ad esempio, è sbagliato condurre un LRT su un …

16 mixed-model maximum-likelihood unbiased-estimator likelihood-ratio reml

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Quando * non * dovrei consentire a un effetto fisso di variare tra i livelli di un effetto casuale in un modello di effetti misti?

Data una variabile prevista (P), un effetto casuale (R) e un effetto fisso (F), si potrebbero adattare due * modelli di effetti misti ( sintassi lme4 ): m1 = lmer( P ~ (1|R) + F ) m2 = lmer( P ~ (1+F|R) + F) A quanto ho capito, il secondo …

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Trattare con singolare vestibilità in modelli misti

Diciamo che abbiamo un modello mod <- Y ~ X*Condition + (X*Condition|subject) # Y = logit variable # X = continuous variable # Condition = values A and B, dummy coded; the design is repeated # so all participants go through both Conditions # subject = random effects for different …

16 mixed-model lme4-nlme overfitting singular

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Intuizione sulla stima dei parametri in modelli misti (parametri di varianza vs. modalità condizionali)

Ho letto molte volte che gli effetti casuali (BLUP / modalità condizionate per, per esempio, soggetti) non sono parametri di un modello lineare di effetti misti ma possono invece essere derivati dai parametri di varianza / covarianza stimati. Ad esempio Reinhold Kliegl et al. (2011) dichiara: Gli effetti casuali sono …

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Come adattare un modello misto con una variabile di risposta compresa tra 0 e 1?

Sto cercando di utilizzare lme4::glmer()per adattare un modello misto generalizzato binomiale (GLMM) con una variabile dipendente che non è binaria, ma una variabile continua tra zero e uno. Si può pensare a questa variabile come a una probabilità; in effetti è la probabilità riportata da soggetti umani (in un esperimento …

15 r logistic mixed-model glmm lme4-nlme

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Scrivere l'equazione matematica per un modello di effetti misti multilivello

La domanda del CV Sto cercando di fornire una (a) rappresentazione matematica dettagliata e concisa di un modello di effetti misti. Sto usando il lme4pacchetto in R. Qual è la rappresentazione matematica corretta per il mio modello? I dati, la domanda scientifica e il codice R. Il mio set di …

15 r mixed-model multilevel-analysis lme4-nlme

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Effetto fisso vs effetto casuale quando tutte le possibilità sono incluse in un modello di effetti misti

In un modello a effetti misti la raccomandazione è di usare un effetto fisso per stimare un parametro se sono inclusi tutti i livelli possibili (ad esempio, sia maschi che femmine). Si consiglia inoltre di utilizzare un effetto casuale per tenere conto di una variabile se i livelli inclusi sono …

15 mixed-model random-effects-model fixed-effects-model many-categories

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Qual è l'intuizione dietro i campioni scambiabili sotto l'ipotesi nulla?

I test di permutazione (chiamati anche test di randomizzazione, test di ri-randomizzazione o test esatto) sono molto utili e sono utili quando l'assunzione della distribuzione normale richiesta da per esempio t-testnon è soddisfatta e quando la trasformazione dei valori per classifica del test non parametrici come Mann-Whitney-U-testquesto porterebbero alla perdita …

15 hypothesis-testing permutation-test exchangeability r statistical-significance loess data-visualization normal-distribution pdf ggplot2 kernel-smoothing probability self-study expected-value normal-distribution prior correlation time-series regression heteroscedasticity estimation estimators fisher-information data-visualization repeated-measures binary-data panel-data mathematical-statistics coefficient-of-variation normal-distribution order-statistics regression machine-learning one-class probability estimators forecasting prediction validation finance measurement-error variance mean spatial monte-carlo data-visualization boxplot sampling uniform chi-squared goodness-of-fit probability mixture theory gaussian-mixture regression statistical-significance p-value bootstrap regression multicollinearity correlation r poisson-distribution survival regression categorical-data ordinal-data ordered-logit regression interaction time-series machine-learning forecasting cross-validation binomial multiple-comparisons simulation false-discovery-rate r clustering frequency wilcoxon-mann-whitney wilcoxon-signed-rank r svm t-test missing-data excel r numerical-integration r random-variable lme4-nlme mixed-model weighted-regression power-law errors-in-variables machine-learning classification entropy information-theory mutual-information

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Visualizzazione dei risultati di modelli misti

Uno dei problemi che ho sempre avuto con i modelli misti è capire le visualizzazioni dei dati - del tipo che potrebbe finire su un foglio o un poster - una volta che si ottengono i risultati. In questo momento, sto lavorando a un modello di effetti misti Poisson con …

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Come testare l'effetto di una variabile di raggruppamento con un modello non lineare?

Ho una domanda sull'uso di una variabile di raggruppamento in un modello non lineare. Poiché la funzione nls () non consente le variabili fattoriali, ho avuto difficoltà a capire se si può testare l'effetto di un fattore sull'adattamento del modello. Di seguito ho incluso un esempio in cui voglio adattare …

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Quali sono le differenze tra "Modellazione di effetti misti" e "Modellazione di crescita latente"?

Ho una discreta familiarità con i modelli di effetti misti (MEM), ma un collega recentemente mi ha chiesto come si confronta con i modelli di crescita latente (LGM). Ho fatto un po 'di ricerche su Google, e sembra che LGM sia una variante della modellazione di equazioni strutturali che viene …

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Confronto di modelli di effetti misti con lo stesso numero di gradi di libertà

Ho un esperimento che proverò ad astrarre qui. Immagina di lanciare tre pietre bianche davanti a te e di chiederti di esprimere un giudizio sulla loro posizione. Registro una varietà di proprietà delle pietre e la tua risposta. Lo faccio su una serie di argomenti. Genero due modelli. Uno è …

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Perché non riesco ad abbinare l'output glmer (family = binomial) con l'implementazione manuale dell'algoritmo Gauss-Newton?

Vorrei abbinare le uscite di lmer (davvero glmer) con un esempio binomiale di giocattoli. Ho letto le vignette e credo di capire cosa sta succedendo. Ma a quanto pare non lo faccio. Dopo essermi bloccato, ho corretto la "verità" in termini di effetti casuali e ho seguito solo la stima …

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