Sappiamo che dobbiamo applicare correzioni tipo Benjamini Hochberg per test di ipotesi multiple su esperimenti basati su un singolo set di dati, al fine di controllare il tasso di scoperta falsa, altrimenti tutti gli esperimenti che danno un risultato positivo potrebbero essere falsi. Ma perché non applichiamo questo stesso principio …
Ho valori di p da molti test e vorrei sapere se in realtà c'è qualcosa di significativo dopo aver corretto per più test. La complicazione: i miei test non sono indipendenti. Il metodo a cui sto pensando (una variante del metodo del prodotto di Fisher, Zaykin et al., Genet Epidemiol …
Ho letto il seguente documento: Perneger (1998) Cosa c'è che non va nelle regolazioni di Bonferroni . L'autore ha riassunto affermando che l'aggiustamento di Bonferroni ha, nella migliore delle ipotesi, applicazioni limitate nella ricerca biomedica e non dovrebbe essere usato quando si valutano prove su ipotesi specifiche: Punti di riepilogo: …
Sto usando JMP per esaminare le differenze nella copertura vegetale nei gruppi di forme di crescita (alberi, arbusti, alberi, ecc.) Prima e dopo tre trattamenti con un controllo. La mia dimensione del campione è piccola (n = 5) e la maggior parte delle mie distribuzioni non sono normalmente distribuite. Per …
Andrew Gelman ha scritto un ampio articolo sul perché i test Bayesian AB non richiedono la correzione di ipotesi multiple: perché (di solito) non dobbiamo preoccuparci dei confronti multipli , 2012. Non capisco bene: perché i metodi bayesiani non richiedono più correzioni di test? A ~ Distribution1 + Common Distribution …
Sto eseguendo NNN test statistici indipendenti con la stessa ipotesi nulla e vorrei combinare i risultati in un valore . Sembra che ci siano due metodi "accettati": il metodo di Fisher e il metodo di Stouffer .ppp La mia domanda riguarda il metodo di Stouffer. Per ogni test separato ottengo …
Quando eseguiamo esperimenti (su campioni di piccole dimensioni (di solito la dimensione del campione per gruppo di trattamento è di circa 7 ~ 8)) su due gruppi, utilizziamo un test t per verificare la differenza. Tuttavia, quando eseguiamo un ANOVA (ovviamente per più di due gruppi), usiamo qualcosa sulla falsariga …
Ho due domande su quando usare un aggiustamento Bonferroni: È appropriato utilizzare un aggiustamento Bonferroni in tutti i casi di test multipli? Se si esegue un test su un set di dati, quindi si divide tale set di dati in livelli più fini (ad es. Dividere i dati per genere) …
Dopo aver eseguito l'analisi dei componenti principali (PCA), voglio proiettare un nuovo vettore nello spazio PCA (ovvero trovare le sue coordinate nel sistema di coordinate PCA). Ho calcolato PCA in linguaggio R utilizzando prcomp. Ora dovrei essere in grado di moltiplicare il mio vettore per la matrice di rotazione PCA. …
Sto rivedendo un documento che ha eseguito> 15 test 2x2 Chi Square separati. Ho suggerito di dover correggere più confronti, ma hanno risposto affermando che tutti i confronti erano pianificati e quindi non è necessario. Penso che questo non debba essere corretto, ma non riesco a trovare risorse che affermino …
Ho sentito che quando molte specifiche del modello di regressione (diciamo, in OLS) sono considerate come possibilità per un set di dati, ciò causa molteplici problemi di confronto e i valori di p e gli intervalli di confidenza non sono più affidabili. Un esempio estremo di ciò è la regressione …
Qual è il metodo preferito per condurre post-hocs nell'ambito dei test dei soggetti? Ho visto lavori pubblicati in cui viene impiegato HSD di Tukey, ma una recensione di Keppel e Maxwell & Delaney suggerisce che la probabile violazione della sfericità in questi progetti rende il termine di errore errato e …
Ho letto questo fantastico articolo di David Colquhoun: un'indagine sul tasso di false scoperte e sull'errata interpretazione dei valori p (2014). In sostanza, spiega perché il tasso di rilevamento falso (FDR) può raggiungere il anche se controlliamo l'errore di tipo I con α = 0,05 .30%30%30\%α=0.05α=0.05\alpha=0.05 Tuttavia, sono ancora confuso …
Quanto è conservativa la correzione multipla dei test Benjamini-Hochberg rispetto al numero totale di confronti? Ad esempio, se ho un elenco di 18.000 funzioni per due gruppi ed eseguo un test Wilcoxon per ottenere un valore p. Adeguo quel valore p usando Benjamini-Hochberg e quasi nulla risulta così significativo. So …
Questo un esercizio dato in teoria della probabilità: La logica della scienza da Edwin Jaynes, 2003. C'è una soluzione parziale qui . Ho elaborato una soluzione parziale più generale e mi chiedevo se qualcun altro l'ha risolta. Aspetterò un po 'prima di pubblicare la mia risposta, per provare gli altri. …
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