Domande taggate «lme4-nlme»

lme4 e nlme sono pacchetti R utilizzati per il montaggio di modelli di effetti misti lineari, lineari generalizzati e non lineari. Per domande generali sui modelli misti utilizzare il tag [modello misto].

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Cheat sheet di R's lmer
Ci sono molte discussioni in corso su questo forum sul modo corretto di specificare vari modelli gerarchici usando lmer. Ho pensato che sarebbe bello avere tutte le informazioni in un unico posto. Un paio di domande per iniziare: Come specificare più livelli, in cui un gruppo è nidificato nell'altro: è …
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Effetti casuali incrociati vs nidificati: in che modo differiscono e come vengono specificati correttamente in lme4?
Ecco come ho compreso gli effetti casuali nidificati o incrociati: Gli effetti casuali nidificati si verificano quando un fattore di livello inferiore appare solo all'interno di un determinato livello di un fattore di livello superiore. Ad esempio, gli alunni delle classi in un determinato momento. In lme4ho pensato che rappresentiamo …
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Quanto dovremmo avere paura degli avvisi di convergenza in lme4
Se rielaboriamo un bagliore, potremmo ricevere un avviso che ci dice che il modello sta trovando difficoltà a convergere ... ad es >Warning message: In checkConv(attr(opt, "derivs"), opt$par, ctrl = control$checkConv, : Model failed to converge with max|grad| = 0.00389462 (tol = 0.001) un altro modo per verificare la convergenza …
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Cos'è la carenza di rango e come gestirla?
Il montaggio di una regressione logistica con lme4 termina con Error in mer_finalize(ans) : Downdated X'X is not positive definite. Una probabile causa di questo errore è apparentemente la carenza di rango. Cos'è la carenza di rango e come devo affrontarla?
87 r  logistic  lme4-nlme 
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In che modo esattamente un "modello a effetti casuali" in econometria si collega a modelli misti al di fuori di econometria?
Pensavo che il "modello a effetti casuali" in econometria corrispondesse a un "modello misto con intercettazione casuale" al di fuori dell'econometria, ma ora non ne sono sicuro. Vero? L'econometria usa termini come "effetti fissi" e "effetti casuali" in modo leggermente diverso dalla letteratura sui modelli misti, e questo provoca una …
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Interpretazione del predittore e / o della risposta trasformati in tronchi
Mi chiedo se fa differenza nell'interpretazione se solo le variabili dipendenti, dipendenti e indipendenti, o solo le variabili indipendenti, vengono trasformate in log. Considera il caso di log(DV) = Intercept + B1*IV + Error Posso interpretare il IV come l'aumento percentuale, ma come cambia quando lo faccio log(DV) = Intercept …
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Intervallo di predizione per il modello di effetti misti lmer () in R
Voglio ottenere un intervallo di previsione attorno a una previsione da un modello lmer (). Ho trovato alcune discussioni su questo: http://rstudio-pubs-static.s3.amazonaws.com/24365_2803ab8299934e888a60e7b16113f619.html http://glmm.wikidot.com/faq ma sembrano non tenere conto dell'incertezza degli effetti casuali. Ecco un esempio specifico. Sto correndo pesce d'oro. Ho dei dati sulle ultime 100 gare. Voglio prevedere il …
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Perché glmer non raggiunge la massima probabilità (come verificato applicando un'ulteriore ottimizzazione generica)?
Derivare numericamente gli MLE di GLMM è difficile e, in pratica, lo so, non dovremmo usare l'ottimizzazione della forza bruta (ad esempio, usando optimin modo semplice). Ma per il mio scopo educativo, voglio provarlo per assicurarmi di capire correttamente il modello (vedi il codice qui sotto). Ho scoperto che ottengo …
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Quanto sono affidabili gli intervalli di confidenza per gli oggetti lmer attraverso il pacchetto effetti?
EffectsIl pacchetto fornisce un modo molto veloce e conveniente per tracciare risultati di modelli a effetto misto lineare ottenuti attraverso il lme4pacchetto . La effectfunzione calcola gli intervalli di confidenza (IC) molto rapidamente, ma quanto sono affidabili questi intervalli di confidenza? Per esempio: library(lme4) library(effects) library(ggplot) data(Pastes) fm1 <- lmer(strength …
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Modello di effetti misti con annidamento
Ho i dati raccolti da un esperimento organizzato come segue: Due siti, ciascuno con 30 alberi. 15 sono trattati, 15 controllano ogni sito. Da ogni albero, campioniamo tre pezzi dello stelo e tre pezzi delle radici, quindi 6 campioni di livello 1 per albero che è rappresentato da uno dei …
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