Statistiche e Big Data mixed-model

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Quali sono le misure facili da interpretare, la bontà di adattamento per i modelli lineari ad effetti misti?

Attualmente sto usando il pacchetto R lme4 . Sto usando un modello lineare di effetti misti con effetti casuali: library(lme4) mod1 <- lmer(r1 ~ (1 | site), data = sample_set) #Only random effects mod2 <- lmer(r1 ~ p1 + (1 | site), data = sample_set) #One fixed effect + # …

37 r regression mixed-model random-effects-model

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Quanto sono affidabili gli intervalli di confidenza per gli oggetti lmer attraverso il pacchetto effetti?

EffectsIl pacchetto fornisce un modo molto veloce e conveniente per tracciare risultati di modelli a effetto misto lineare ottenuti attraverso il lme4pacchetto . La effectfunzione calcola gli intervalli di confidenza (IC) molto rapidamente, ma quanto sono affidabili questi intervalli di confidenza? Per esempio: library(lme4) library(effects) library(ggplot) data(Pastes) fm1 <- lmer(strength …

36 r mixed-model confidence-interval effects lme4-nlme

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In quali condizioni si dovrebbe usare l'analisi multilivello / gerarchica?

A quali condizioni qualcuno dovrebbe prendere in considerazione l'uso di analisi multilivello / gerarchica anziché analisi più basilari / tradizionali (ad es. ANOVA, regressione OLS, ecc.)? Ci sono situazioni in cui ciò potrebbe essere considerato obbligatorio? Ci sono situazioni in cui l'utilizzo dell'analisi multilivello / gerarchica è inappropriato? Infine, quali …

36 mixed-model multilevel-analysis

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Che cos'è la simmetria composta in un inglese semplice?

Di recente mi sono reso conto che un modello misto con solo soggetto come fattore casuale e gli altri fattori come fattori fissi equivalgono a un ANOVA quando si imposta la struttura correlativa del modello misto su simmetria composta. Pertanto, vorrei sapere cosa significa simmetria composta nel contesto di un …

35 correlation anova mixed-model lme4-nlme

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Modello di effetti misti con annidamento

Ho i dati raccolti da un esperimento organizzato come segue: Due siti, ciascuno con 30 alberi. 15 sono trattati, 15 controllano ogni sito. Da ogni albero, campioniamo tre pezzi dello stelo e tre pezzi delle radici, quindi 6 campioni di livello 1 per albero che è rappresentato da uno dei …

34 r mixed-model model nested-data lme4-nlme

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Come posso verificare se un effetto casuale è significativo?

Sto cercando di capire quando usare un effetto casuale e quando non è necessario. Mi è stato detto che una regola empirica è se hai 4 o più gruppi / individui che faccio (15 alci individuali). Alcuni di questi alci sono stati sperimentati 2 o 3 volte per un totale …

34 mixed-model lme4-nlme random-effects-model glmm

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Differenza tra modelli lineari generalizzati e modelli misti lineari generalizzati

Mi chiedo quali siano le differenze tra GLM misti e non miscelati. Ad esempio, in SPSS il menu a discesa consente agli utenti di adattare: analyze-> generalized linear models-> generalized linear models & analyze-> mixed models-> generalized linear Trattano diversamente i valori mancanti? La mia variabile dipendente è binaria e …

34 mixed-model generalized-linear-model glmm gee

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Perché c'è una differenza tra il calcolo manuale di un intervallo di confidenza della regressione logistica del 95% e l'uso della funzione confint () in R?

Carissimi, ho notato qualcosa di strano che non posso spiegare, vero? In sintesi: l'approccio manuale al calcolo di un intervallo di confidenza in un modello di regressione logistica e la funzione R confint()danno risultati diversi. Ho attraversato la regressione logistica applicata di Hosmer & Lemeshow (2a edizione). Nel terzo capitolo …

34 r regression logistic confidence-interval profile-likelihood correlation mcmc error mixture measurement data-augmentation r logistic goodness-of-fit r time-series exponential descriptive-statistics average expected-value data-visualization anova teaching hypothesis-testing multivariate-analysis r r mixed-model clustering categorical-data unsupervised-learning r logistic anova binomial estimation variance expected-value r r anova mixed-model multiple-comparisons repeated-measures project-management r poisson-distribution control-chart project-management regression residuals r distributions data-visualization r unbiased-estimator kurtosis expected-value regression spss meta-analysis r censoring regression classification data-mining mixture

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Scostamento sulla somma dei valori previsti da un modello di effetti misti in una serie temporale

Ho un modello a effetti misti (in effetti un modello misto additivo generalizzato) che mi dà previsioni per una serie. Per contrastare l'autocorrelazione, uso un modello corCAR1, dato che ho dei dati mancanti. I dati dovrebbero darmi un carico totale, quindi devo sommare l'intero intervallo di previsione. Ma dovrei anche …

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Come posso adattare un modello multilivello per risultati di dispersione eccessivamente dispersi?

Voglio montare un GLMM multilivello con una distribuzione di Poisson (con sovra dispersione) usando R. Al momento sto usando lme4 ma ho notato che recentemente la quasipoissonfamiglia è stata rimossa. Ho visto altrove che è possibile modellare l'eccessiva dispersione additiva per le distribuzioni binomiali aggiungendo un'intercettazione casuale con un livello …

32 r mixed-model poisson-distribution lme4-nlme overdispersion

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Confronti multipli su un modello di effetti misti

Sto cercando di analizzare alcuni dati usando un modello a effetti misti. I dati che ho raccolto rappresentano il peso di alcuni giovani animali di diverso genotipo nel tempo. Sto usando l'approccio proposto qui: https://gribblelab.wordpress.com/2009/03/09/repeated-measures-anova-using-r/ In particolare sto usando la soluzione n. 2 Quindi ho qualcosa del genere require(nlme) model …

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Cosa fa il comando anova () con un oggetto modello lmer?

Spero che questa sia una domanda a cui qualcuno qui può rispondere per me sulla natura della scomposizione di somme di quadrati da un modello a effetti misti adatto lmer(dal pacchetto lme4 R). Prima di tutto, dovrei dire che sono a conoscenza della controversia con l'utilizzo di questo approccio e …

30 r anova mixed-model lme4-nlme

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Confronto tra lme e lmer

Mi chiedevo se qualcuno potesse illuminarmi sulle attuali differenze tra queste due funzioni. Ho trovato la seguente domanda: Come scegliere la libreria nlme o lme4 R per i modelli di effetti misti? , ma risale a un paio d'anni fa. È una vita nei circoli del software. Le mie domande …

30 r mixed-model lme4-nlme

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Come ottenere un valore p "complessivo" e una dimensione dell'effetto per un fattore categoriale in un modello misto (lme4)?

Vorrei ottenere un valore p e una dimensione dell'effetto di una variabile categoriale indipendente (con più livelli) - che è "complessiva" e non per ogni livello separatamente, come è l'output normale di lme4in R. È proprio come la cosa che la gente riferisce quando esegue un ANOVA. Come posso ottenerlo?

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Come interpretare la varianza e la correlazione degli effetti casuali in un modello a effetti misti?

Spero che a tutti voi non dispiaccia questa domanda, ma ho bisogno di aiuto per interpretare l'output per un output del modello a effetti misti lineari. Ho cercato di imparare a fare in R. Sono nuovo nell'analisi dei dati longitudinali e nella regressione lineare degli effetti misti. Ho un modello …

28 r mixed-model interpretation panel-data

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