I modelli misti (aka multilivello o gerarchici) sono modelli lineari che includono sia effetti fissi che casuali. Sono utilizzati per modellare dati longitudinali o nidificati.
Sto cercando di passare dall'uso del ezpacchetto a lmemisure ripetute ANOVA (poiché spero di poter usare contrasti personalizzati con lme). Seguendo i consigli di questo post sul blog sono stato in grado di impostare lo stesso modello usando entrambi aov(come fa ez, quando richiesto) e lme. Tuttavia, mentre nell'esempio riportato …
Ho esaminato questa panoramica delle formule lm / lmer R di @conjugateprior e mi sono confuso con la seguente voce: Ora supponiamo che A sia casuale, ma B sia fisso e B sia nidificato all'interno di A. aov(Y ~ B + Error(A/B), data=d) Di seguito lmer(Y ~ B + (1 …
Mi chiedo se ci sono metodi per calcolare la dimensione del campione in modelli misti? Sto usando lmerin R per adattarsi ai modelli (ho pendenze e intercettazioni casuali).
In che modo i modelli di effetti misti (lineari) vengono normalmente confrontati tra loro? So che è possibile utilizzare i test del rapporto di verosimiglianza, ma ciò non funziona se un modello non è un "sottoinsieme" dell'altro corretto? La stima dei modelli df è sempre semplice? Numero di effetti fissi …
Abbiamo eseguito una regressione logistica a effetti misti utilizzando la sintassi seguente; # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) Oggetto e oggetto sono gli effetti casuali. Stiamo ottenendo un risultato dispari che è il coefficiente …
Durante una conferenza ho sentito la seguente dichiarazione: 100 misurazioni per 5 soggetti forniscono molte meno informazioni rispetto a 5 misurazioni per 100 soggetti. È abbastanza ovvio che questo è vero, ma mi chiedevo come si potesse dimostrarlo matematicamente ... Penso che si possa usare un modello misto lineare. Tuttavia, …
Ho un esperimento di misure ripetute in cui la variabile dipendente è una percentuale e ho più fattori come variabili indipendenti. Mi piacerebbe usare glmerdal pacchetto R lme4per trattarlo come un problema di regressione logistica (specificando family=binomial) poiché sembra adattarsi direttamente a questa configurazione. I miei dati si presentano così: …
Di recente ho intrapreso il montaggio di modelli misti di regressione nel framework bayesiano, utilizzando un algoritmo MCMC (funzione MCMCglmm in R in realtà). Credo di aver capito come diagnosticare la convergenza del processo di stima (traccia, grafico geweke, autocorrelazione, distribuzione posteriore ...). Una delle cose che mi colpisce nel …
Ho eseguito un modello misto lineare generalizzato in R e ho incluso un effetto di interazione tra due predittori. L'interazione non era significativa, ma gli effetti principali (i due predittori) erano entrambi. Ora molti esempi di libri di testo mi dicono che se c'è un effetto significativo dell'interazione, gli effetti …
Dopo aver eseguito l'analisi dei componenti principali (PCA), voglio proiettare un nuovo vettore nello spazio PCA (ovvero trovare le sue coordinate nel sistema di coordinate PCA). Ho calcolato PCA in linguaggio R utilizzando prcomp. Ora dovrei essere in grado di moltiplicare il mio vettore per la matrice di rotazione PCA. …
Con il seguente set di dati, volevo vedere se la risposta (effetto) cambia in relazione a siti, stagione, durata e loro interazioni. Alcuni forum online sulle statistiche mi hanno suggerito di continuare con i modelli lineari a effetti misti, ma il problema è che, poiché i replicati sono randomizzati all'interno …
Ho lavorato con alcuni dati che hanno alcuni problemi con misurazioni ripetute. In tal modo ho notato un comportamento molto diverso tra lme()e lmer()utilizzando i miei dati di test e voglio sapere perché. Il set di dati falsi che ho creato ha misurazioni di altezza e peso per 10 soggetti, …
Comprendo che la differenza tra loro è correlata al fatto che la variabile di raggruppamento nel modello sia stimata come un effetto fisso o casuale, ma non mi è chiaro perché non siano gli stessi (se non sono uguali). Sono particolarmente interessato a come funziona quando si utilizza la stima …
Un collega sta analizzando alcuni dati biologici per la sua tesi con una cattiva eteroscedasticità (figura sotto). Lo sta analizzando con un modello misto ma sta ancora riscontrando problemi con i residui. Trasformare il registro delle variabili di risposta pulisce le cose e in base al feedback a questa domanda …
Ho usato l'imputazione multipla per ottenere un numero di set di dati completati. Ho usato i metodi bayesiani su ciascuno dei set di dati completati per ottenere distribuzioni posteriori per un parametro (un effetto casuale). Come posso combinare / raggruppare i risultati per questo parametro? Più contesto: Il mio modello …
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