Statistiche e Big Data post-hoc

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Quale metodo di confronto multiplo utilizzare per un modello lmer: lsmeans o glht?

Sto analizzando un set di dati usando un modello di effetti misti con un effetto fisso (condizione) e due effetti casuali (partecipante a causa del disegno e della coppia all'interno del soggetto). Il modello è stato generato conlme4 pacchetto: exp.model<-lmer(outcome~condition+(1|participant)+(1|pair),data=exp). Successivamente, ho eseguito un test del rapporto di verosimiglianza di …

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Come ottenere i risultati di un test post-hoc Tukey HSD in una tabella che mostra le coppie raggruppate?

Mi piacerebbe eseguire un test post-hoc TukeyHSD dopo il mio Anova a due vie con R, ottenendo una tabella contenente le coppie ordinate raggruppate per differenza significativa. (Mi dispiace per il testo, sono ancora nuovo con le statistiche.) Vorrei avere qualcosa del genere: Quindi, raggruppati con stelle o lettere. Qualche …

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Sidak o Bonferroni?

Sto usando un modello lineare generalizzato in SPSS per esaminare le differenze nel numero medio di bruchi (non normale, usando la distribuzione di Tweedie) su 16 diverse specie di piante. Voglio eseguire più confronti, ma non sono sicuro se dovrei usare un test di correzione Sidak o Bonferroni. Qual è …

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Come eseguire l'imputazione dei valori in un numero molto elevato di punti dati?

Ho un set di dati molto grande e mancano circa il 5% di valori casuali. Queste variabili sono correlate tra loro. Il seguente set di dati R è solo un esempio di giocattolo con dati correlati fittizi. set.seed(123) # matrix of X variable xmat <- matrix(sample(-1:1, 2000000, replace = TRUE), …

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Come eseguire il confronto post-hoc sul termine di interazione con il modello a effetti misti?

Sto lavorando su un set di dati per valutare l'impatto dell'essiccazione sulle attività microbiche dei sedimenti. L'obiettivo è determinare se l'impatto dell'essiccazione varia tra i tipi di sedimenti e / o la profondità all'interno del sedimento. Il design sperimentale è il seguente: Il primo fattore Sedimento corrisponde a tre tipi …

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Come applicare correttamente il test post-hoc Nemenyi dopo il test di Friedman

Sto confrontando le prestazioni di più algoritmi su più set di dati. Poiché non è garantito che tali misurazioni delle prestazioni siano distribuite normalmente, ho scelto il Friedman Test con il test post-hoc Nemenyi basato su Demšar (2006) . Ho quindi trovato un altro documento che, oltre a suggerire altri …

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Test post-hoc in multcomp :: glht per modelli a effetti misti (lme4) con interazioni

Sto eseguendo test post-hoc su un modello lineare a effetti misti in R( lme4pacchetto). Sto usando il multcomppacchetto ( glht()funzione) per eseguire i test post-hoc. Il mio disegno sperimentale è misure ripetute, con un effetto blocco casuale. I modelli sono specificati come: mymod <- lmer(variable ~ treatment * time + …

10 mixed-model post-hoc lsmeans lme4-nlme

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Come ottenere l'intervallo di confidenza sul cambio di r-square della popolazione

Per un semplice esempio, supponiamo che ci siano due modelli di regressione lineare Modello 1 ha tre predittori, x1a, x2b, ex2c Il modello 2 ha tre predittori dal modello 1 e due predittori aggiuntivi x2aex2b Esiste un'equazione di regressione della popolazione in cui la varianza della popolazione spiegata è per …

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Che cos'è un'analisi post-hoc valida per una ANOVA di misure ripetute a tre vie?

Ho eseguito una misurazione ripetuta a tre vie ANOVA; quali analisi post hoc sono valide? Questo è un design completamente bilanciato (2x2x2) con uno dei fattori che hanno una misura ripetuta all'interno dei soggetti. Sono a conoscenza di approcci multivariati a misure ripetute ANOVA in R, ma il mio primo …

10 r anova repeated-measures interaction post-hoc

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È tutto in famiglia; ma includiamo anche i suoceri?

Supponiamo di avere un esperimento con due o più fattori. Viene costruito un ANOVA generale, e quindi seguiamo due o più serie di test post hoc , diciamo confronti multipli. La mia domanda è su quanto grandi --- e quante --- famiglie dovrebbero essere usate come base per aggiustamenti di …

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Il test di Mann-Whitney può essere utilizzato per confronti post-hoc dopo Kruskal-Wallis?

Ho una simulazione in cui un animale viene posto in un ambiente ostile e temporizzato per vedere quanto tempo può sopravvivere usando un approccio alla sopravvivenza. Ci sono tre approcci che può usare per sopravvivere. Ho eseguito 300 simulazioni dell'animale usando ogni approccio di sopravvivenza. Tutte le simulazioni avvengono nello …

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Come può un test Tukey HSD essere più significativo del valore P non corretto di t.test?

Sono venuto dal post " Confronti post-hoc a coppie di ANOVA a due vie " (rispondendo a questo post ), che mostra quanto segue: dataTwoWayComparisons <- read.csv("http://www.dailyi.org/blogFiles/RTutorialSeries/dataset_ANOVA_TwoWayComparisons.csv") model1 <- aov(StressReduction~Treatment+Age, data =dataTwoWayComparisons) summary(model1) # Treatment is signif pairwise.t.test(dataTwoWayComparisons$StressReduction, dataTwoWayComparisons$Treatment, p.adj = "none") # no signif pair TukeyHSD(model1, "Treatment") # mental-medical …

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