Statistiche e Big Data cox-model

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Come segnalare i rapporti di rischio da un modello di rischio proporzionale Cox in inglese?

La mia comprensione è che un rapporto di rischio da un modello di rischi proporzionali di Cox confronta l'effetto sulla percentuale di rischio di un dato fattore con un gruppo di riferimento. Come lo riferiresti a un pubblico che non conosce le statistiche? Proviamo a pronunciare un esempio. Supponiamo di …

13 survival cox-model

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Pacchetto GBM vs. Caret tramite GBM

Ho usato il tuning del modello caret, ma poi rieseguendo il modello usando il gbmpacchetto. Comprendo che il caretpacchetto utilizza gbme l'output dovrebbe essere lo stesso. Tuttavia, solo un rapido test eseguito utilizzando data(iris)mostra una discrepanza nel modello di circa il 5% utilizzando RMSE e R ^ 2 come metrica …

13 r caret gbm matrix linear-algebra logistic modeling logit ordered-logit r confidence-interval survival population weibull classification separation hypothesis-testing correlation statistical-significance p-value python r data-visualization r regression multiple-regression chi-squared multivariate-analysis distributions random-variable experiment-design distributions poisson-regression residuals excel time-series garch var survival modeling cox-model interaction r pca normality-assumption

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Come generare curve di sopravvivenza previste da modelli di fragilità (usando R coxph)?

Voglio calcolare la funzione di sopravvivenza prevista per un modello di rischi proporzionali di Cox con termini di fragilità [usando il pacchetto di sopravvivenza]. Sembra che quando i termini di fragilità sono nel modello, la funzione di sopravvissuto prevista non può essere calcolata. ## Example require(survival) data(rats) ## Create fake …

13 r survival cox-model frailty

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Come stimare la funzione di rischio basale nel modello Cox con R

Devo stimare la funzione di rischio di base in un modello Cox dipendente dal tempoλ0(t)λ0(t)\lambda_0(t) λ(t)=λ0(t)exp(Z(t)′β)λ(t)=λ0(t)exp⁡(Z(t)′β)\lambda(t) = \lambda_0(t) \exp(Z(t)'\beta) Mentre ho seguito il corso di sopravvivenza, ricordo che la derivata diretta della funzione di rischio cumulativo ( ) non sarebbe un buon stimatore perché lo stimatore di Breslow fornisce una …

13 r survival cox-model

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Come creare i dati di sopravvivenza di un giocattolo (tempo dell'evento) con la corretta censura

Vorrei creare un giocattolo di sopravvivenza (tempo all'evento) che sia correttamente censurato e segua una certa distribuzione con pericoli proporzionali e pericoli costanti di base. Ho creato i dati come segue, ma non sono in grado di ottenere rapporti di rischio stimati vicini ai valori reali dopo aver adattato un …

12 survival cox-model monte-carlo

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Test esatto di Fisher e distribuzione ipergeometrica

Volevo capire meglio il test esatto del pescatore, quindi ho escogitato il seguente esempio di giocattolo, dove f e m corrispondono a maschio e femmina e n e y corrispondono a "consumo di soda" in questo modo: > soda_gender f m n 0 5 y 5 0 Ovviamente, questa è …

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Residui di Schoenfeld

In un modello di rischio proporzionale di Cox con molte variabili, se i residui di Schoenfeld non sono piatti per una delle variabili, ciò invalida l'intero modello o può essere ignorata solo la variabile con scarso rendimento? Cioè, interpretare i coefficienti per le altre variabili, ma non interpretare i coefficienti …

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Come calcolare le percentuali di rischio previste da un modello Cox PH?

Ho il seguente modello di Cox PH: (Tempo, Evento) ~ X + Y + Z Vorrei ottenere il pericolo previste tariffe (sto parlando di tassi di rischio NON hazard ratio) indicati valori specifici di X, Y, Z. So che il pacchetto muhaz R può calcolare le percentuali di rischio osservate, …

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Qual è il modo migliore per analizzare i dati relativi alla durata del soggiorno in un RCT ospedaliero?

Sono interessato a sapere se esiste o meno un consenso sul modo ottimale di analizzare i dati relativi alla durata del ricovero ospedaliero (LOS) da un RCT. Si tratta in genere di una distribuzione molto inclinata a destra, in base alla quale la maggior parte dei pazienti viene dimessa in …

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Ponderazione del punteggio di propensione nell'analisi di Cox PH e selezione della covariata

Per quanto riguarda la ponderazione del punteggio di propensione (IPTW) durante la modellizzazione proporzionale del rischio di Cox dei dati di sopravvivenza tempo-evento: Ho potenziali dati di registro in cui siamo interessati a esaminare l'effetto terapeutico di un farmaco che nella maggior parte dei casi i pazienti stavano già assumendo …

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Confronto di CPH, modello temporale accelerato di fallimento o reti neurali per analisi di sopravvivenza

Sono nuovo nell'analisi di sopravvivenza e ho recentemente appreso che ci sono diversi modi per farlo dato un determinato obiettivo. Sono interessato all'attuazione effettiva e all'adeguatezza di questi metodi. Mi sono stati presentati i tradizionali modelli di rischio proporzionale di Cox , modelli temporali di fallimento accelerato e reti neurali …

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Come fa il coxph () di R a gestire misure ripetute?

Contesto Sto cercando di capire come R's coxph () accetta e gestisce le voci ripetute per soggetti (o paziente / cliente, se preferisci). Alcuni lo chiamano formato lungo, altri lo chiamano "misure ripetute". Vedere ad esempio il set di dati che include la colonna ID nella sezione Risposte all'indirizzo: I …

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C'è qualche differenza funzionale tra un odds ratio e il hazard ratio?

Nella regressione logistica, un odds ratio di 2 significa che l'evento è 2 volte più probabile dato un aumento di una unità nel predittore. Nella regressione di Cox, un hazard ratio di 2 significa che l'evento si verificherà due volte più spesso in ogni momento dato un aumento di una …

10 logistic cox-model odds-ratio hazard

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Valore “nascosto” della variabile categoriale della regressione lineare

Questo è solo un esempio che ho riscontrato più volte, quindi non ho dati di esempio. Esecuzione di un modello di regressione lineare in R: a.lm = lm(Y ~ x1 + x2) x1è una variabile continua. x2è categorico e ha tre valori, ad esempio "Basso", "Medio" e "Alto". Tuttavia, l'output …

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Le curve di Kaplan-Meier sembrano dire diversamente dalla regressione di Cox

In R, sto facendo analisi dei dati di sopravvivenza dei malati di cancro. Ho letto cose molto utili sull'analisi di sopravvivenza in CrossValidated e in altri luoghi e penso di aver capito come interpretare i risultati della regressione di Cox. Tuttavia, un risultato mi infastidisce ancora ... Sto confrontando la …

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