Statistiche e Big Data survival

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Qual è la differenza tra l'output "coef" e "(exp) coef" di coxph in R?

Ho cercato di discernere cosa significano esattamente i risultati "coef" e "(exp) coef" di coxph. Sembra che i "(exp) coef" siano confronti della prima variabile nel modello in base al gruppo assegnato nel comando. In che modo la funzione coxph arriva ai valori di "coef" e "(exp) coef"? Inoltre, in …

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Come possono essere utilizzati modelli di apprendimento automatico (GBM, NN ecc.) Per l'analisi della sopravvivenza?

So che i modelli statistici tradizionali come la regressione dei rischi proporzionali di Cox e alcuni modelli di Kaplan-Meier possono essere utilizzati per prevedere giorni prima che si verifichi il verificarsi di un evento, ad esempio un fallimento, ecc. Analisi di sopravvivenza Domande Come può essere utilizzata la versione di …

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La spiegazione di Layman sulla censura nell'analisi della sopravvivenza

Ho letto cos'è la censura e come deve essere spiegata nell'analisi di sopravvivenza, ma mi piacerebbe ascoltarne una definizione meno matematica e una definizione più intuitiva (le immagini sarebbero fantastiche!). Qualcuno può darmi una spiegazione di 1) censura e 2) come influisce su cose come le curve di Kaplan-Meier e …

13 survival cox-model censoring

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L'adattamento del modello Cox con gli strati e l'interazione strati-covariata differisce dal montaggio di due modelli Cox?

In Regressione Modeling Strategies di Harrell (seconda edizione) c'è una sezione (S. 20.1.7) che discute i modelli di Cox tra cui un'interazione tra una covariata di cui vogliamo stimare anche l'effetto principale sulla sopravvivenza (età nell'esempio seguente) e un covariata di cui non vogliamo stimare l'effetto principale (genere nell'esempio seguente). …

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Interpretazione e validazione di un modello di regressione dei rischi proporzionali di Cox usando R in un inglese semplice

Qualcuno può spiegarmi il mio modello Cox in un inglese semplice? Ho adattato il seguente modello di regressione di Cox a tutti i miei dati usando la cphfunzione. I miei dati vengono salvati in un oggetto chiamato Data. Le variabili w, xe ysono continue; zè un fattore di due livelli. …

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Come segnalare i rapporti di rischio da un modello di rischio proporzionale Cox in inglese?

La mia comprensione è che un rapporto di rischio da un modello di rischi proporzionali di Cox confronta l'effetto sulla percentuale di rischio di un dato fattore con un gruppo di riferimento. Come lo riferiresti a un pubblico che non conosce le statistiche? Proviamo a pronunciare un esempio. Supponiamo di …

13 survival cox-model

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Pacchetto GBM vs. Caret tramite GBM

Ho usato il tuning del modello caret, ma poi rieseguendo il modello usando il gbmpacchetto. Comprendo che il caretpacchetto utilizza gbme l'output dovrebbe essere lo stesso. Tuttavia, solo un rapido test eseguito utilizzando data(iris)mostra una discrepanza nel modello di circa il 5% utilizzando RMSE e R ^ 2 come metrica …

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Un modello di regressione la cui variabile di risposta è il giorno dell'anno in cui si verifica (di solito) un evento annuale

In questo caso particolare mi riferisco al giorno in cui un lago si congela. Questa data di "congelamento" si verifica solo una volta all'anno, ma a volte non si verifica affatto (se l'inverno è caldo). Quindi un anno il lago potrebbe congelare il giorno 20 (20 gennaio) e un altro …

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Come generare curve di sopravvivenza previste da modelli di fragilità (usando R coxph)?

Voglio calcolare la funzione di sopravvivenza prevista per un modello di rischi proporzionali di Cox con termini di fragilità [usando il pacchetto di sopravvivenza]. Sembra che quando i termini di fragilità sono nel modello, la funzione di sopravvissuto prevista non può essere calcolata. ## Example require(survival) data(rats) ## Create fake …

13 r survival cox-model frailty

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Come stimare la funzione di rischio basale nel modello Cox con R

Devo stimare la funzione di rischio di base in un modello Cox dipendente dal tempoλ0(t)λ0(t)\lambda_0(t) λ(t)=λ0(t)exp(Z(t)′β)λ(t)=λ0(t)exp⁡(Z(t)′β)\lambda(t) = \lambda_0(t) \exp(Z(t)'\beta) Mentre ho seguito il corso di sopravvivenza, ricordo che la derivata diretta della funzione di rischio cumulativo ( ) non sarebbe un buon stimatore perché lo stimatore di Breslow fornisce una …

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Modellazione quando la variabile dipendente ha un "cut-off"

Ci scusiamo in anticipo se la terminologia che uso non è corretta. Gradirei qualsiasi correzione. Se quello che descrivo come un "cut-off" ha un nome diverso, fammi sapere e posso aggiornare la domanda. La situazione che mi interessa è questa: hai variabili indipendenti e una singola variabile dipendente . Lo …

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Quali sono le differenze tra analisi di sopravvivenza e regressione di Poisson?

Sto lavorando a un classico problema di predizione di churn usando il numero di visite di un determinato utente a un sito e ho pensato che la regressione di Poisson fosse lo strumento giusto per modellare il futuro coinvolgimento di quell'utente. Quando poi mi sono imbattuto in un libro sull'analisi …

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Confronta due curve di sopravvivenza per i dati associati

Voglio confrontare due diversi metodi per rilevare il cambiamento di stato in un'analisi di sopravvivenza. Un gruppo di soggetti viene seguito per un periodo più lungo (molti anni) e sono stati utilizzati due metodi di esame per verificare se si è verificato un cambiamento di stato; un metodo è stato …

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Differenze tra PROC Mixed e lme / lmer in R - gradi di libertà

Nota: questa domanda è una risposta, poiché la mia domanda precedente doveva essere cancellata per motivi legali. Confrontando PROC MIXED da SAS con la funzione lmedel nlmepacchetto in R, mi sono imbattuto in alcune differenze piuttosto confuse. Più specificamente, i gradi di libertà nei diversi test differiscono tra PROC MIXEDe …

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Come confrontare la sopravvivenza mediana tra i gruppi?

Sto esaminando la sopravvivenza mediana usando Kaplan-Meier in diversi stati per un tipo di cancro. Ci sono differenze abbastanza grandi tra gli stati. Come posso confrontare la sopravvivenza mediana tra tutti gli stati e determinare quali sono significativamente diversi dalla sopravvivenza mediana media in tutto il paese?

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