Il modello additivo generalizzato (GAM) è un modello lineare generalizzato (GLM) in cui la variabile di risposta dipende da funzioni regolari sconosciute di alcune variabili predittive.
Ho prodotto modelli di additivi generalizzati per la deforestazione. Per tenere conto dell'autocorrelazione spaziale, ho incluso latitudine e longitudine come termine di interazione smussato (es. S (x, y)). Ho basato questo sulla lettura di molti articoli in cui gli autori affermano che "per tenere conto dell'autocorrelazione spaziale, le coordinate dei …
Quando uso GAM, mi dà DF residuo è (ultima riga nel codice). Cosa significa? Andando oltre l'esempio GAM, in generale, il numero di gradi di libertà può essere un numero non intero?26.626.626.6 > library(gam) > summary(gam(mpg~lo(wt),data=mtcars)) Call: gam(formula = mpg ~ lo(wt), data = mtcars) Deviance Residuals: Min 1Q Median …
Uso sempre più i GAM. Quando vado a fornire riferimenti per i loro vari componenti (selezione dei parametri di smoothing, varie basi di spline, valori p di termini uniformi), provengono tutti da un ricercatore: Simon Wood, dell'Università di Bath, in Inghilterra. È anche il manutentore di mgcvin R, che implementa …
Sto sperimentando l'algoritmo della macchina per aumentare il gradiente tramite il caretpacchetto in R. Utilizzando un piccolo set di dati di ammissione al college, ho eseguito il seguente codice: library(caret) ### Load admissions dataset. ### mydata <- read.csv("http://www.ats.ucla.edu/stat/data/binary.csv") ### Create yes/no levels for admission. ### mydata$admit_factor[mydata$admit==0] <- "no" mydata$admit_factor[mydata$admit==1] <- …
Lettura mgcv::gamdella pagina di aiuto: intervalli di confidenza / credibilità sono prontamente disponibili per qualsiasi quantità prevista utilizzando un modello montato Tuttavia, non riesco a trovare un modo per ottenerne effettivamente uno. Ho pensato che predict.gamavrebbe un type=confidencee un levelparametro, ma non lo è. Potete aiutarmi su come crearlo?
Mi rendo conto che questa potrebbe essere una domanda potenzialmente ampia, ma mi chiedevo se ci sono ipotesi generalizzabili che indicano l'uso di un GAM (modello di additivo generalizzato) su un GLM (modello lineare generalizzato)? Qualcuno recentemente mi ha detto che i GAM dovrebbero essere usati solo quando presumo che …
So che R ha librerie gam e mgcv per modelli di additivi generalizzati. Ma ho difficoltà a trovare le loro controparti nell'ecosistema Python (statsmodels ha solo un prototipo nella sandbox). Qualcuno è a conoscenza delle librerie di Python esistenti? Chissà che questo potrebbe essere un buon progetto per sviluppare / …
Contesto : Voglio tracciare una linea in un grafico a dispersione che non appare parametrico, quindi sto usando geom_smooth()in ggplota R. Restituisce automaticamente geom_smooth: method="auto" and size of largest group is >=1000, so using gam with formula: y ~ s(x, bs = "cs"). Use 'method = x' to change the …
Ho esplorato una serie di strumenti per le previsioni e ho scoperto che i modelli di additivi generalizzati (GAM) hanno il massimo potenziale per questo scopo. I GAM sono fantastici! Consentono di specificare in modo molto succinto modelli complessi. Tuttavia, quella stessa sintonia mi sta creando confusione, in particolare per …
Se inseriamo un GAM come: gam.fit = gam::gam(Outstate ~ Private + s(Room.Board, df = 2) + s(PhD, df = 2) + s(perc.alumni, df = 2) + s(Expend, df = 5) + s(Grad.Rate, df = 2), data = College) Dove, usiamo il set di dati College, che può essere trovato all'interno …
Il mgcvpacchetto per Rha due funzioni per adattare le interazioni del prodotto tensore: te()e ti(). Comprendo la divisione di base del lavoro tra i due (adattamento di un'interazione non lineare rispetto alla scomposizione di questa interazione in effetti principali e un'interazione). Quello che non capisco è perché te(x1, x2)e ti(x1) …
Sono interessato a modellare il pescato totale usando gam in mgcv per modellare semplici effetti casuali per le singole navi (che effettuano viaggi ripetuti nel tempo nel settore della pesca). Ho 98 soggetti, quindi ho pensato di usare gam invece di gamm per modellare gli effetti casuali. Il mio modello …
Nel solito calcolo VIF per una regressione lineare, ogni variabile indipendente / esplicativa viene trattata come la variabile dipendente in una regressione dei minimi quadrati ordinaria. vale a direXjXjX_j Xj= β0+ ∑i = 1 , i ≠ jnβioXioXj=β0+Σio=1,io≠jnβioXio X_j = \beta_0 + \sum_{i=1, i \neq j}^n \beta_i X_i I valori …
Domanda : Come posso costruire un test per determinare se la frequenza osservata "montagna" -allele (Fig 1) è significativamente più bassa nelle montagne dal centro al sud di quanto previsto (Fig 2) dal modello di selezione ecologica ( vedi sotto per i dettagli )? Problema : il mio pensiero iniziale …
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